اشتراک‌گذاری مقالات: بررسی پروفایل ویروس پستانداران کوچک وحشی در غرب آفریقا، ویروس‌های جدید و خطرات مشترک بین انسان و دام را آشکار می‌کند

یک مطالعه اخیر منتشر شده درمیکروبیومتجزیه و تحلیل متاژنومیک ویروسی را بر روی ۸۴۶ پستاندار کوچک وحشی - از جمله خفاش‌ها، جوندگان و حشره‌خوارها - که در سیرالئون، غرب آفریقا جمع‌آوری شده بودند، انجام دادند. این مطالعه در مجموع ۳۹ ویروس RNA مرتبط با پستانداران را شناسایی کرد که شامل ۲۶ ویروس جدید و ۱۳ ویروس شناخته شده قبلی بود. در میان این ویروس‌ها، خانواده پارامیکسوویریده بیشترین تنوع را نشان داد، در حالی که جوندگان بیشترین تعداد گونه‌های ویروسی را در خود جای داده بودند (n = ۲۶).

ارزیابی ریسک بیماری‌های مشترک بین انسان و دام، سه ویروس شناخته‌شده مشترک بین انسان و دام - ویروس آنسفالومیوکاردیت، ویروس لاسا و گونه روکاهیپه ویروس - و همچنین سه ویروس با خطر بالقوه سرایت: ویروس ملیان، ویروس هپاتیت جوندگان و ویروس هانی‌آی را آشکار کرد. نکته قابل توجه این است که در میان ویروس‌های تازه شناسایی‌شده، ویروس خفاش لدانته‌ویروس ۲ نزدیکترین رابطه فیلوژنتیکی را با ویروس Le Dantec که انسان را آلوده می‌کند، نشان داد. تجزیه و تحلیل سرولوژیکی همچنین آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده علیه این ویروس را در ۲.۸٪ از ساکنان محلی شناسایی کرد که نشان‌دهنده مواجهه قبلی و احتمالاً ناشناخته انسان با این ویروس است.

این یافته‌ها وجود یک مخزن ویروسی قابل توجه تحت سلطه جوندگان در غرب آفریقا را برجسته می‌کند و اهمیت حیاتی استراتژی‌های نظارتی یکپارچه در سطح مشترک انسان و حیوان را برجسته می‌سازد. ترکیب غربالگری متاژنومیک با اعتبارسنجی سرولوژیکی، چارچوبی قوی برای شناسایی ویروس‌هایی با پتانسیل زئونوز و سرریز فراهم می‌کند.

در طول دهه گذشته، بیش از ۶۰٪ از بیماری‌های عفونی نوظهور در انسان از مخازن حیوانی سرچشمه گرفته‌اند، و خفاش‌ها، جوندگان و موش‌های صحرایی به عنوان میزبان‌های اصلی ویروس‌های مشترک بین انسان و حیوان شناخته شده‌اند. آفریقا به طور گسترده به عنوان کانون بیماری‌های مشترک بین انسان و حیوان در نظر گرفته می‌شود. به عنوان مثال، سیرالئون در طول شیوع ابولا در سال‌های ۲۰۱۴ تا ۲۰۱۶ بیش از ۲۸۰۰۰ مورد گزارش کرد.

علیرغم بار قابل توجه بیماری‌های مشترک بین انسان و دام در این منطقه، تنوع و توزیع ویروس‌ها در پستانداران کوچک وحشی به اندازه کافی مشخص نشده است. برای رفع این شکاف، محققان یک تجزیه و تحلیل سیستماتیک ویروس از ۸۴۶ پستاندار کوچک وحشی که بین سال‌های ۲۰۱۸ تا ۲۰۲۳ در سه منطقه در سیرالئون صید شده بودند، انجام دادند. هدف این مطالعه مشخص کردن تنوع ویروسی، شناسایی کاندیداهایی با پتانسیل انتقال بین گونه‌ای، ارزیابی خطر مشترک بین انسان و دام و ایجاد شواهدی برای پشتیبانی از سیستم‌های هشدار اولیه برای بیماری‌های عفونی نوظهور بود.

روش‌های اصلی

این مطالعه از یک گردش کار جامع متاژنومیکس ویروسی استفاده کرد:

• پردازش نمونه:بافت‌های قلب، کبد، طحال، ریه و کلیه جمع‌آوری، مخلوط، همگن‌سازی و تحت استخراج RNA کل قرار گرفتند.
• توالی‌یابی و مونتاژ:قبل از ساخت کتابخانه، حذف RNA ریبوزومی انجام شد و پس از آن با استفاده از پلتفرم Illumina NovaSeq 6000، توالی‌یابی با توان عملیاتی بالا انجام شد. قطعات ویروسی از نو مونتاژ شدند.
• شناسایی ویروس:ویروس‌ها بر اساس هم‌ترازی ژن RNA پلیمراز وابسته به RNA (RdRp) شناسایی شدند. فقط ویروس‌های مرتبط با مهره‌داران، به استثنای ویروس‌های باکتریایی، قارچی و گیاهی، حفظ شدند.
• تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک:بازسازی فیلوژنتیک، تجزیه و تحلیل نوترکیبی، مدل‌سازی شبکه انتقال بین گونه‌ای و ارزیابی ریسک بیماری‌های مشترک بین انسان و دام انجام شد.
• اعتبارسنجی سرولوژیکی:یک روش خنثی‌سازی شبه‌ویروس مبتنی بر VSV برای ویروس خفاش لدانته‌ویروس ۲ توسعه داده شد. آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده در ۲.۸٪ از سرم‌های انسانی شناسایی شدند که شواهدی از انتقال بالقوه مشترک بین انسان و دام ارائه می‌دهد.
  

  مطالعهنتایج

  ۱. کشف و تنوع ویروسی

  این مطالعه، تجزیه و تحلیل توالی‌یابی ترانسکریپتومیک را بر روی ۸۴۶ حیوان وحشی جمع‌آوری‌شده در سیرالئون، از جمله جوندگان، خفاش‌ها و موش‌های صحرایی انجام داد. بر اساس توالی‌های کامل ژن RNA پلیمراز وابسته به RNA (RdRp)، در مجموع ۳۹ ویروس RNA مرتبط با پستانداران شناسایی شد که شامل ۱۳ ویروس شناخته‌شده قبلی و ۲۶ ویروس جدید بود.

  از نظر ترکیب ویروسی، خانواده پارامیکسوویریده بالاترین سطح تنوع را در هر سه راسته میزبان نشان داد و پس از آن آستروویریده و پیکورناویریده قرار داشتند. در مورد توزیع میزبان، جوندگان با داشتن ۲۶ گونه ویروس، بیشترین تنوع ویروسی را به خود اختصاص دادند که نشان دهنده نقش برجسته آنها به عنوان مخازن تنوع ویروسی در منطقه است.

  ۲. خطر ابتلا به بیماری‌های مشترک بین انسان و دام

  ارزیابی ریسک بیماری‌های مشترک بین انسان و دام، سه ویروس شناخته‌شده مشترک بین انسان و دام را شناسایی کرد: ویروس آنسفالومیوکاردیت، ویروس لاسا و گونه‌های روکاهیپه ویروس. علاوه بر این، سه ویروس - ویروس ملیان، ویروس هپاتیت جوندگان و هانی‌ویروس A - به عنوان ویروس‌های دارای پتانسیل سرایت شناسایی شدند.

  از میان ۲۶ ویروس تازه کشف‌شده، بر اساس ویژگی‌های فیلوژنتیکی و ژنومی، پیش‌بینی می‌شد که چهار ویروس پتانسیل بالایی برای انتقال بیماری به انسان داشته باشند. نکته قابل توجه این است که ویروس خفاش لدانت ۲ نزدیکترین رابطه فیلوژنتیکی را با ویروس شناخته‌شده Le Dantec که انسان را آلوده می‌کند، نشان داد.

  تحقیقات سرولوژیکی بعدی این یافته را بیشتر تأیید کرد، زیرا آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده علیه ویروس خفاش لدانته‌ویروس ۲ در ۲.۸٪ از سرم‌های ساکنان محلی شناسایی شدند. این نتیجه نشان می‌دهد که عفونت‌های ناشناخته یا بدون علامت ممکن است قبلاً در جمعیت انسانی رخ داده باشند، که نشان‌دهنده یک مسیر انتقال بالقوه اما قبلاً ناشناخته از طریق حیوانات خانگی است.

  ۳. دینامیک انتقال بین گونه‌ای

  تجزیه و تحلیل انتقال بین گونه‌ای نشان داد که جوندگان جایگاه مرکزی را در شبکه اشتراک ویروسی اشغال می‌کنند و به عنوان گره‌های کلیدی عمل می‌کنند که تبادل ویروسی بین گونه‌های میزبان را تسهیل می‌کنند. در مجموع ۱۵ ویروس شناسایی شدند که پتانسیل انتقال بین گونه‌ای را دارند.

  تجزیه و تحلیل بیشتر الگوهای انتقال بین گونه‌ای نشان داد که اشتراک‌گذاری ویروسی بیشتر در بین میزبان‌هایی در یک رده طبقه‌بندی رخ می‌دهد، که نشان می‌دهد ارتباط میزبان نقش مهمی در پویایی انتقال ایفا می‌کند. در مقابل، خفاش‌ها ظرفیت نسبتاً کمتری برای انتقال بین گونه‌ای نشان دادند.

  نکته مهم این است که شواهدی از گسترش دامنه میزبانی در ویروس‌های خاصی مشاهده شد. به عنوان مثال، ویروس ملیان، که قبلاً مختص حشره‌خوارها در نظر گرفته می‌شد، در این مطالعه در جوندگان نیز شناسایی شد که نشان‌دهنده تغییر بالقوه در سازگاری میزبان و افزایش خطر انتقال گسترده‌تر است.

  

  نتیجه‌گیری‌ها و پیامدهای بهداشت عمومی

  • تنوع بالای ویروم در پستانداران کوچک وحشی:کشف ۳۹ ویروس RNA، شامل ۲۶ گونه جدید، نشان‌دهنده یک مخزن بزرگ ویروس در منطقه است و برای اولین بار از ویروس‌های جدیدی با پتانسیل بالای انتقال بیماری بین انسان و دام (مانند ویروس خفاش لدانت ۲) خبر می‌دهد.
  • جوندگان به عنوان اهداف نظارتی اولویت‌دار:جوندگان به عنوان مراکز کلیدی انتقال ویروس عمل می‌کنند و بالاترین تنوع ویروسی را دارند که نشان‌دهنده بیشترین خطر سرایت است.
  • نیاز به استراتژی‌های نظارتی یکپارچه:این یافته‌ها از اولویت‌بندی جوندگان در برنامه‌های نظارتی فعال و اجرای رویکردهای یکپارچه با ترکیب متاژنومیکس، سرولوژی و پایش اکولوژیکی در سطوح تماس انسان و حیات وحش پشتیبانی می‌کنند.

  به طور کلی، این مطالعه شواهد مهمی را برای پشتیبانی از سیستم‌های هشدار اولیه و چارچوب‌های ارزیابی ریسک برای بیماری‌های مشترک بین انسان و دام نوظهور ارائه می‌دهد و اهمیت نظارت پیشگیرانه در مناطق پرخطر را تقویت می‌کند.

  اطلاعات محصول