واکنش چند کشوری به خوشه هانتاویروس آند: NAAT و توالی‌یابی کل ژنوم به عنوان ابزارهای حیاتی

در آوریل ۲۰۲۶، کشتی کروز اکتشافی قطبی با پرچم هلندام اس هوندیوساز اوشوایا، آرژانتین حرکت کرد. در 6 آوریل، یکی از مسافران دچار تب و سردرد شد و پنج روز بعد در هواپیما درگذشت. همسر او نیز بیمار شد و پس از انتقال به آفریقای جنوبی درگذشت. متعاقباً، آزمایش هانتاویروس یک مسافر 69 ساله بریتانیایی مثبت شد و همچنان در بخش مراقبت‌های ویژه بستری است. تا تاریخ 13 مه، سازمان بهداشت جهانی گزارش داد۱۱ مورد ابتلا و ۳ مورد فوتیمرتبط با شیوع بیماری در کشتی.

I. بررسی اجمالی ویروس و انواع بیماری‌زا

هانتاویروس‌ها گروهی از ویروس‌های RNA هستند که عمدتاً توسط جوندگان حمل می‌شوند و متعلق به جنس Orthohantavirus در خانواده Bunyaviridae می‌باشند. ژنوم آنها شامل موارد زیر است:سه بخش (L، M و S)، به ترتیب RNA پلیمراز وابسته به RNA، گلیکوپروتئین‌ها و پروتئین نوکلئوکپسید را کد می‌کنند. بر اساس توزیع جغرافیایی و تظاهرات بالینی، هانتاویروس‌ها به دو دسته طبقه‌بندی می‌شوند:دو گروه عمده:

هانتاویروس‌های دنیای قدیم(که در اروپا، آسیا و آفریقا یافت می‌شود) باعثتب خونریزی دهنده همراه با سندرم کلیوی (HFRS)ویروس‌های نماینده شامل ویروس هانتان (HTNV)، ویروس سئول (SEOV) و ویروس پومالا (PUUV) هستند. آن‌ها در درجه اول کلیه‌ها را هدف قرار می‌دهند و منجر به اختلال کلیوی، تظاهرات خونریزی دهنده و در موارد شدید، شوک می‌شوند. میزان مرگ و میر بر اساس نوع ویروس متفاوت است، اما به طور کلی از ...کمتر از ۱٪ تا ۵-۱۵٪.

هانتاویروس‌های دنیای جدید(که در آمریکای شمالی و جنوبی در گردش است) باعث می‌شودسندرم ریوی هانتاویروس (HPS)ویروس‌های نماینده شامل ویروس Sin Nombre (SNV) و ویروس Andes (ANDV) هستند. آن‌ها در درجه اول ریه‌ها را هدف قرار می‌دهند و باعث ادم ریوی غیر قلبی با شروع سریع، دیسترس تنفسی شدید و اختلال قلبی عروقی می‌شوند. علائم اولیه شبیه آنفولانزا (تب، درد عضلانی، شکایات گوارشی) هستند، اما بیماری می‌تواند به سرعت به نارسایی تنفسی پیشرفت کند، بامیزان مرگ و میر به 30 تا 50 درصد می‌رسد.

شیوع بیماری در کشتی‌های کروز عمدتاً ناشی از ...ویروس آند (ANDV)، که متعلق بهسندرم ریوی هانتاویروس (HPS)زیرگروه

دوم. هانتاویروس‌های مرتبط با HFRS سنتی در مقابل ویروس آند (HPS)

HFRS سنتی

III. راه‌های انتقال

هانتاویروس عمدتاً از طریق ... منتقل می‌شود.تماس مستقیم با مدفوع، بزاق یا ادرار جوندگان آلودهیا توسطاستنشاق فضولات آئروسل شدهسایر مسیرهای ممکن عبارتند از:

-گزش یا خراشیده شدن توسط جوندگان آلوده؛

- خوردن غذای آلوده به ادرار، مدفوع یا بزاق جوندگان آلوده؛

- لمس چشم‌ها، بینی یا دهان پس از تماس با اشیاء آلوده.

انتقال از انسان به انسان بسیار نادر است، اما تأیید شده استویروس آند (ANDV).

چهارم. ردیابی جهانی تماس با هانتاویروس - آزمایش اسید نوکلئیک و توالی‌یابی به عنوان فناوری‌های اصلی

پس از شیوع ANDV، مقامات بهداشتی در بیش از ده کشور - از جمله اسپانیا، انگلستان، ایالات متحده، کانادا و سوئیس - همزمان ردیابی تماس‌ها و نظارت بر قرنطینه را آغاز کردند. فرانسه، ایالات متحده و سایر کشورها همچنان به پیگیری وضعیت سلامت شهروندان خود که از کشتی آلوده بازگشته‌اند، ادامه داده‌اند.

در این واکنش اضطراری چند کشوری،آزمایش اسید نوکلئیک و تعیین توالی ژنومینقش اساسی و غیرقابل انکاری ایفا کرده‌اند:

-آزمایش اسید نوکلئیکشواهد قطعی برای شناسایی سریع پاتوژن ارائه می‌دهد؛

-توالی‌یابی ژنومیشواهد مولکولی غیرقابل جایگزینی برای ردیابی منبع عفونت، تأیید زنجیره‌های انتقال و ارزیابی تغییرات ویروسی ارائه می‌دهد.

V. راهکارهای تشخیص هانتاویروس (به ویژه نوع HPS)

۱. شناسایی زودهنگام پاتوژن

۱.۱ آزمایش در محل مراقبت (POCT)
غربالگری دقیق و آزمایش‌های اورژانسی -از نمونه تا نتیجه در ۱ ساعت.
چالش‌های تشخیصی و راه‌حل‌های سریع مولکولی آزمایش در محل مراقبت
۱.۲ PCR مرسوم
PCR معمولی

۲. راهکارهای تعیین توالی

برای شناسایی پاتوژن و ردیابی شیوع در مواردتب با منشا ناشناخته، دیسترس تنفسی یا تظاهرات خونریزی دهنده.
تظاهرات خونریزی دهنده

ویژگی‌های اصلی:

ویژگی‌های اصلی

ششم. داده‌های عملکرد تأیید شده

توالی‌یابی کل ژنوم مبتنی بر جذب کاوشگر از نمونه‌های مثبت هانتاویروس انجام شدپوشش ژنومی >99% در عمق 30x.
داده‌های عملکرد تأیید شده

ژنوتیپ‌بندی و تجزیه و تحلیل نسبت زیرگروه‌های ویروس هانتا مبتنی بر فاضلاب امکان‌پذیر است.
نسبت زیرگروه

VII. کیت‌های مرتبط

کیت‌های مرتبط


زمان ارسال: ۱۴ مه ۲۰۲۶